Les infections bactériennes, virales, algales et protozoaires sont courantes après exposition à de l'eau contaminée. Nager dans des étangs, des lacs et des océans qui sont à proximité de zones développées peut augmenter votre risque d'exposition à la contamination des eaux usées si les zones ont des installations d'eaux usées ou de traitement des eaux usées inadéquates ou surchargées. Consultez un médecin dès l'apparition de la fièvre après la baignade, surtout si vous voyagez en dehors des États-Unis.
La leptospirose est une infection causée par bactérie en forme de tire-bouchon du genre Leptospira, qui passe dans les fèces et l'urine des mammifères affectés et se caractérise par de la fièvre, des frissons et des maux de tête intenses. Des chercheurs de l'Institut Robert Koch de Berlin ont identifié un cas de leptospirose chez un athlète de triathlon après avoir terminé la partie de natation de l'événement dans la rivière Neckar à l'extérieur d'Heidelberg. Les équipes médicales ont tenté de contacter tous les participants pour déterminer les risques d'une éventuelle épidémie. Sur les 142 participants qui ont répondu, cinq autres cas ont été confirmés. Les auteurs ont déclaré que les fortes pluies précédant l'événement ont très probablement conduit à la contamination de l'eau et que les plaies ouvertes étaient probablement le point d'entrée de la bactérie.
Les entérovirus sont des parasites intestinaux qui peuvent contaminer l'eau par les excréments humains et provoquer diverses maladies, y compris la méningite, une maladie inflammatoire du cerveau et de la moelle épinière marquée par une fièvre soudaine, une paralysie et un état mental altéré. Un article du numéro de septembre 2008 de «Clinical Infectious Disease» décrit une épidémie de méningite virale parmi un groupe scolaire revenant d'un voyage au Mexique. Sur les 29 voyageurs, 21 sont tombés malades quatre jours après une longue baignade dans le golfe du Mexique. Les résultats des tests ont confirmé la méningite virale et l'analyse statistique a montré que le temps passé à nager était positivement corrélé à la survenue de l'infection. Les chercheurs ont conclu que le groupe nageait probablement dans de l'eau de mer polluée par les eaux usées.
Lyngbya majuscule est un type d'algue qui fleurit dans l'eau de mer tropicale et libère des toxines qui causent maladies marquées par des éruptions cutanées, des troubles gastro-intestinaux, des maux de tête et de la fièvre. Un article d'avril 2003 dans "Environmental International" a évalué la santé des nageurs de Moreton Bay, en Australie, pendant une floraison d'algues. Les chercheurs ont envoyé par la poste 5000 questionnaires aux résidents sur les activités nautiques récréatives et la survenue de maladies. Sur les 1350 répondants, 78% ont déclaré être dans l'eau au moment de la floraison et 34% ont déclaré un ou plusieurs symptômes, l'irritation cutanée étant la plus fréquente. Bien qu'un nombre relativement important de répondants aient signalé des symptômes de toxicité algale, seuls 29 semblaient graves.
Une étude publiée dans le numéro d'avril 2005 du "Journal of the Medical Association of Thailand" "a rapporté le cas d'un homme se plaignant d'une fièvre de faible intensité, de maux de tête et de mucus sanglant dans les écoulements nasaux pendant une semaine. Les médecins ont découvert qu'il avait nagé dans un étang naturel deux à trois jours avant l'apparition des symptômes. L'examen microscopique de l'écoulement nasal a révélé la présence de deux types d'amibes flagellées: les espèces Naegleria et Acanthamoeba. Les auteurs ont conclu qu'il s'agissait du premier signalement d'une double infection d'amibes vivant en liberté chez un patient vivant.